me_edu
Биоинформатика и genomics data: последовательности, базы данных и анализ вариантовШаг 9 из 13 · 0% пройдено
Последовательности и данные

Quality control

Шаг 9 из 1310 минТеория
Цель

Понять основной механизм темы «Quality control» без заучивания отдельных терминов.

Как работать

Прочитайте блок один раз целиком, затем вернитесь к схеме или примеру и перескажите идею своими словами.

Критерий

Сформулированное правило, пример применения и одно ограничение метода.

COMPARATIVE CHART · LINEAR SCALE01836557391сред.86quality72coverage91mappingmax18duplicates24biasкатегориязначениеЧтениеmax: mappingmin: duplicates×5.1Среднее 58 · максимум 91 · минимум 18
Sequencing QC: качество, покрытие, mapping, duplicates and bias определяют надежность анализа
Опорная идея

QC проверяет, можно ли доверять данным: read quality, adapter contamination, coverage, duplication, mapping rate and bias. Плохой QC не всегда означает, что данные бесполезны, но он ограничивает вывод. В медицине особенно опасно делать сильные утверждения на слабых данных.

Профессиональный отчет сначала описывает качество данных, а уже затем biological interpretation.

Назад

Обсуждение

Войдите, чтобы участвовать в обсуждении.

Пока нет сообщений.